“百人計(jì)劃”研究員邱東茹事跡材料

國內(nèi)分子微生物學(xué)的頂尖引路人
——記中科院水生生物研究所“百人計(jì)劃”研究員邱東茹事跡材料

邱東茹校友1989年本科畢業(yè)于華中師范大學(xué)生物系，獲學(xué)士學(xué)位。1992年同校植物學(xué)專業(yè)碩士研究生畢業(yè)后到中科院水生所工作，任研究實(shí)習(xí)員和助理研究員，從事水生植物和凈化生物學(xué)研究。博士，研究員，學(xué)科組長，博士生導(dǎo)師。2011年獲中科院“百人計(jì)劃”資助。曾在歐、美、日多家研究開發(fā)機(jī)構(gòu)接受訓(xùn)練和從事科研工作10余年。在PNAS、AEM等國際主流期刊和國內(nèi)核心期刊上發(fā)表學(xué)術(shù)論文40余篇，其中包括SCI高頻引用論文2篇；獲得美國及國際專利兩項(xiàng)。主要從事細(xì)菌分子遺傳（假單胞菌、希瓦氏菌、枯草芽胞桿菌和納豆菌）和環(huán)境生物技術(shù)研究。目前正在開發(fā)病原微生物（包括細(xì)菌和真菌）檢測的基因芯片。
從環(huán)境生物學(xué)到分子微生物學(xué)
邱東茹博士早年的研究以環(huán)境生物學(xué)為主。在華中師大攻讀碩士學(xué)位期間，在陳德懋教授的指導(dǎo)下，研究了鄂東南幕阜山區(qū)種子植
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a-glutamic acids, PGA）生物合成調(diào)控機(jī)理。這期間發(fā)表SCI論文兩篇（SCI引用近20次），EI論文一篇。隨后又在Marshall大學(xué)參與美國航空航天局（NASA）項(xiàng)目“銅綠假單胞菌生物膜”的研究，基本闡明了假單胞菌從非粘液野生型（Non-mucoid）向大量產(chǎn)藻酸鹽（Alginate）的粘液型轉(zhuǎn)換（Mucoid conversion）的信號傳導(dǎo)機(jī)制，即環(huán)境壓力引起周質(zhì)空間變性外膜蛋白的聚集，變性外膜蛋白外露的羧基端氨基酸三聯(lián)體（如-WVF）引發(fā)周質(zhì)空間、細(xì)胞質(zhì)膜和細(xì)胞質(zhì)內(nèi)多種蛋白酶 （AlgW, MucP和Clp*P）介導(dǎo)的抗Sigma因子MucA 的切割和最終降解，釋放出質(zhì)膜外功能Sigma因子AlgU，進(jìn)而調(diào)節(jié)藻酸鹽的大量合成，藻酸鹽吸收水分使細(xì)菌呈現(xiàn)粘液態(tài)（抗逆和抗免疫系統(tǒng)）。這些工作發(fā)表在“美國科學(xué)院院報(bào)”（PNAS）上。哈佛醫(yī)學(xué)院G. Pier教授在Faculty 1000 of Biology上評價(jià)和推薦此文,論文發(fā)表后的短時(shí)間內(nèi)就被SCI引用達(dá)50多次；英文專著引用3次）。邱東茹校友這期的工作還發(fā)表在“微生物學(xué)”（Microbiology, UK）、“應(yīng)用與環(huán)境生物學(xué)”（AEM）和“細(xì)菌學(xué)雜志”（JB）等國際微生物主流期刊上，獲得美國專利兩項(xiàng)。所構(gòu)建的pHERD系列質(zhì)粒為國內(nèi)外多家實(shí)驗(yàn)室索取和使用（SCI引用已達(dá)30余次，包括發(fā)表在Cell和Nature上的論文）。
之后邱東茹校友前往Oklahoma大學(xué)環(huán)境基因組研究所工作，參與多項(xiàng)美國能源部（DOE）GTL（Genes to Life）項(xiàng)目課題的工作，主要研究對象為金屬還原菌Shewanella屬細(xì)菌，建立了適用于Shewanella屬細(xì)菌基因組足跡分析技術(shù)（Tn-seq），發(fā)現(xiàn)了細(xì)菌低溫適應(yīng)相關(guān)基因和新型機(jī)理。鑒定出一系列與細(xì)菌低溫適應(yīng)相關(guān)的基因。構(gòu)建了高產(chǎn)原卟啉I*的工程菌株（美國專利申請中）。
回國建立分子微生物學(xué)與生物技術(shù)實(shí)驗(yàn)室
2011年邱東茹校友離開美國回國工作。在水生所組建分子微生物學(xué)與生物技術(shù)實(shí)驗(yàn)室，帶領(lǐng)以年輕學(xué)者（一名實(shí)驗(yàn)員、2名博士后、3名博士生和3名碩士生）為主的團(tuán)隊(duì)，開展細(xì)菌無氧呼吸與低溫適應(yīng)機(jī)理、細(xì)胞質(zhì)膜外功能sigma因子、鐵氧化細(xì)菌形成黑褐色沉淀和胞外多糖的機(jī)理以及細(xì)菌溶解微囊藻的分子機(jī)理和納豆激酶等多項(xiàng)研究課題的研究。已取得階段性成果，篩選到兩類強(qiáng)殺（微囊）藻劑并開展其溶藻機(jī)理研究；發(fā)現(xiàn)鐵錳氧化細(xì)菌是造成湖北省某縣自來水中黑褐沉淀物的主要原因，分離到一株纖發(fā)菌（Leptothri*）RN12并鑒定出若干與胞外多糖合成相關(guān)的基因；揭示微氧條件下細(xì)菌硝酸鹽還原的特點(diǎn)和調(diào)節(jié)機(jī)制；揭示希瓦氏菌中兩個(gè)ECF sigma因子的細(xì)胞功能及調(diào)節(jié)機(jī)理。已完成多篇論文，已有三篇論文發(fā)表或被接受，其中一篇被AEM（Applied and Environmental Microbiology）接受。
近年來，邱東茹博士主持中科院“百人計(jì)劃”擇優(yōu)支持等多項(xiàng)重點(diǎn)課題。我們期望，邱東茹博士的研究工作能為我國富營養(yǎng)化湖泊和水庫有毒微囊藻水華的控制、水污染治理和工業(yè)生物技術(shù)作出應(yīng)有的貢獻(xiàn)。

邱東茹簡介：
邱東茹，男，1968年7月出生，湖北麻城人。現(xiàn)任中國科學(xué)院水生生物研究所研究員、學(xué)科組長（PI），中科院“百人計(jì)劃”入選者。1989年本科畢業(yè)于華中師范大學(xué)生物系，獲學(xué)士學(xué)位。1992年同校植物學(xué)專業(yè)碩士研 ……（未完，全文共2904字，當(dāng)前僅顯示1846字，請閱讀下面提示信息。收藏《“百人計(jì)劃”研究員邱東茹事跡材料》）