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論文開題報(bào)告:基于TRAP標(biāo)記的半夏遺傳多樣性研究

發(fā)表時(shí)間:2013/9/12 10:25:58


大學(xué)本科畢業(yè)論文(設(shè)計(jì))開題報(bào)告
學(xué)院: 化工學(xué)院            專業(yè)班級(jí): 08園藝 
課題名稱 基于TRAP標(biāo)記的半夏遺傳多樣性研究

1、本課題的的研究目的和意義:

遺傳多樣性是物種和生態(tài)多樣性的基礎(chǔ),一般指種內(nèi)不同_和個(gè)體遺傳多態(tài)性程度即種內(nèi)基因變化。 種內(nèi)遺傳多樣性豐富,物種對(duì)環(huán)境的變化適應(yīng)能力強(qiáng),進(jìn)化潛力大。 由于現(xiàn)在半夏盲目引種,栽培不規(guī)范及栽培環(huán)境不合格導(dǎo)致半夏種內(nèi)基因變異及品種退化,藥材產(chǎn)量下降,影響經(jīng)濟(jì)效益,開展遺傳多樣性研究對(duì)半夏分類,品種鑒定,引種和培育新品種具有巨大意義。

2、 文獻(xiàn)綜述(國(guó)內(nèi)外研究情況及其發(fā)展):


靶位區(qū)域擴(kuò)增多態(tài)性(Target Region Amplified Polymorphism,TRAP) 是一種新型的基于 PCR的分
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、親緣關(guān)系和遺傳多樣性等方面取得了進(jìn)展.
3、 本課題的主要研究?jī)?nèi)容(提綱)和成果形式:
1.提取半夏材料基因組DNA。
2.用已篩選的引物組合對(duì)全國(guó)不同產(chǎn)地和表型的半夏居群DNA進(jìn)行TRAP遺傳多樣性分析。
4、擬解決的關(guān)鍵問題:

做聚丙烯下難凝膠電泳時(shí),保證上樣孔的平整,上樣時(shí)使產(chǎn)物和溴酚藍(lán)混合均勻,電泳條帶清晰。

5、研究思路、方法和步驟:

步驟:(1)依次用H2O、ddH2O充分洗滌玻璃板和間隔片,再用無(wú)水乙醇擦拭玻璃板,晾干。直接用無(wú)水乙醇清洗樣品梳。
(2)凝膠膜板的裝配:
①將較大的(不帶凹口)玻璃板平放在實(shí)驗(yàn)臺(tái)上。
②用少量凡士林輕涂間隔片,防止其滑動(dòng)。
③將內(nèi)板(帶凹口的玻璃板)放在(不帶凹口)玻璃板上,放妥。
④用夾子將兩玻板夾緊,為防止漏膠,底邊用防水膠帶密封。
⑤將兩玻板夾在制膠板上,并放入瓊脂糖密封槽中。注意:玻板要放在密封槽的中間,使玻板的四周都留有空間,以便瓊脂糖能夠流到玻板的前后左右。
⑥制備一定量(每塊膠約需30ml)的1%的瓊脂糖溶液,加熱使之透明澄清。趁熱倒入瓊脂糖密封槽中,膠凝固后可以密封玻板底部的側(cè)面和底面。
(3)聚丙烯酰胺凝膠的制備
根據(jù)玻璃板大小及間隔片厚度計(jì)算所需凝膠體積,并配膠、灌膠。(注意:操作時(shí)要戴手套!并且在托盤上進(jìn)行,以免溶液濺出!操作動(dòng)作要迅速。
①吸取9.95ml 30%丙烯酰胺、29.7ml dH2O、10ml 5*TBE放入小燒杯中,混勻。(6.0%的聚丙烯酰胺凝膠)
②再加入0.35ml 10%過硫酸胺、0.0175ml TEMED,輕輕旋轉(zhuǎn)混勻。
③將垂直膠板略傾斜,小心將凝膠倒入兩塊玻璃板之間,待凝膠離板頂約3mm處停止。
④膠板垂直放好,插入合適的樣品梳,勿使梳齒下形成氣泡,若有氣泡,用1mL注射器吸出。
⑤室溫中聚合1~2h,若凝膠回縮明顯,應(yīng)補(bǔ)加。梳齒下出現(xiàn)折光帶時(shí),表明聚合反應(yīng)已經(jīng)完成。
(4)電泳
①聚合完成后,在梳子周圍及其頂部噴些1*TBE,小心取出梳子。
②用1mL注射器吸取1*TBE沖洗加樣孔,小心移去瓊脂糖密封槽,用解剖刀小心除去凝膠底部的膠帶,回收瓊脂糖。
③將凝膠直立放入電泳槽,注意有凹口的玻璃板朝里,面向緩沖液槽放置,用夾板固定好。
④在電泳槽的上下槽中灌滿1*TBE溶液,驅(qū)盡凝膠底部附著的氣泡。用1*TBE溶液沖洗加樣孔。
⑤微量移液器在點(diǎn)樣板上:5μl DNA +1μl 6*Loading Buffer,充分吹吸混勻。上樣時(shí),切勿讓樣品溢出槽外。
⑥接通電源,正極與下槽相連。120V電壓下電泳2.5h。
⑦電泳畢,從電泳槽中取出玻璃板,放在工作臺(tái)上,用解剖刀從夾層一角輕撬,移去上面的玻板。用注射器針頭使附著在間隔片內(nèi)側(cè)的凝膠脫離,再用ddH2O小心沖洗下凝膠,置染色液中染色并進(jìn)行結(jié)果觀察。
(5)染色
電泳后采用銀染的方法,銀染主要步驟:
(1)去離子水洗脫3min;
(2)浸泡于0.1%AgNO3染 ……(未完,全文共3235字,當(dāng)前僅顯示1634字,請(qǐng)閱讀下面提示信息。收藏《論文開題報(bào)告:基于TRAP標(biāo)記的半夏遺傳多樣性研究》
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